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mayubonne さん、質問ありがとうございます。
こちらは、WooCommerce for Japan の内容ではないので、WooCommerceのフォーラムの方へ移動させて頂きました。
当方で、WooCommerce 2.6.14 と WordPress4.7.2 と Storefront 2.1.7 でチェックしました。
表示されますね。笑
ただ、「送料を計算」も表示されます。そこで住所を入れると正しい送料が表示される仕組みになっています。

これは、「設定」の「お客様の基本地域」の設定を「デフォルト地域なし」に設定をされていないのではないでしょうか?
「位置情報(Geolocate)」になっているとIPアドレスの位置情報から場所が判断されて送料設定に表示されます。
ただ、「送料を計算」も表示され続けます。
これが正しい状態です。

mayubonne さんの現在の状況はテーマが新しいテンプレートに対応していないか、何かプラグインやテーマで Javascript のコンフリクトを起こしているかのどちらかかと思います。
その辺りで調べられた良いかと思います。

ご参考までに。